Portfolio












            ******************************************************************************************

            * Dokončené projekty
            ******************************************************************************************
                                                                                           
                                                   Zprovoznění výukového softwaru NEST     
                                                   na fakultním HPC clusteru               
                                                                                           
                                                                                           
                                                   Pro Karolínu Korvasovou a výuku předmětu Úvod do
                                                   výpočetní neurovědy na MFF UK jsme realizovali
                                                                                           
                                                   nasazení a integraci simulačního softwaru NEST
                                                   Desktop a NEST Simulator do fakultní výpočetní
                                                   infrastruktury. Řešení umožňuje studentům pracovat
                                                                                           
                                                   s grafickým rozhraním i Jupyter notebooky přímo
                                                   na univerzitním HPC clusteru, bez závislosti na
                                                   externích evropských infrastrukturách.  
                                                                                           
                                                   Součástí práce byla integrace do JupyterHubu, provo
                                                   přes SLURM, kontejnerizace pomocí Apptaineru, úprav
                                                   proxy vrstvy a řešení bezpečnostních a XSRF problém
                                                                                           
                                                   při komunikaci mezi NEST Desktopem, NEST Serverem a
                                                   JupyterHubem [ URL "https://www.mff.cuni.cz/en/hpc-
                                                   cluster/jupyter-hub)."] .               
                                                                                           
                                                                                           
                                                   Zadavatel: Karolína Korvasová, M.Sc., Dr. rer. nat.
                                                   Skupina výpočetních neurověd MFF UK [ URL "https://
                                                                                           
                                                   www.mff.cuni.cz/cs/fakulta/organizacni-struktura/
                                                   katedra/oddeleni?code=8210"]            
                                                                                           
                                                                                           
                                                   Provoz softwaru Origin na Linuxu        
                                                   pro vědecké zpracování dat              
                                                                                           
                                                                                           
                                                   Pro Katedru fyziky kondenzovaných látek jsme řešili
                                                   problém používání analytického softwaru 
                                                                                           
                                                   Origin [ URL "https://www.originlab.com/"] v
                                                   prostředí Linux, které je standardně doporučováno
                                                   pro vědeckou práci a přístup k HPC clusterům,
                                                                                           
                                                   přestože samotný software nemá nativní linuxovou
                                                   verzi. Cílem bylo umožnit linuxovým uživatelům
                                                   plnohodnotnou práci s daty a zachovat kompatibilitu
                                                                                           
                                                   s existujícími projekty a spoluprací napříč
                                                   výzkumnými skupinami.                   
                                                                                           
                                                                                           
                                                   Zadavetel: doc. RNDr. Karel Carva, PhD., Katedra
                                                   fyziky a kondenzovaných látek MFF UK [ URL "https:/
                                                   kfkl.mff.cuni.cz/"]                     
                                                                                           
                                                                                           






            ******************************************************************************************
            *
            ******************************************************************************************